Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clstn1Q9EPL2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clstn1Q9EPL2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms