Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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