Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf6Q9DBU5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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