Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm37309-201ENSMUST00000194994 1639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Riok3Q9DBU3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms