Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms