Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem239Q9DA47 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms