Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smco2Q9DA21 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms