Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp12Q9D9M2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp12Q9D9M2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp12Q9D9M2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms