Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx5Q9D8U8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx5Q9D8U8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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