Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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