Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
4930564D02RikQ9D4S4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
4930564D02RikQ9D4S4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms