Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms