Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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