Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms