Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms