Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms