Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms