Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1lQ9CXF7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1lQ9CXF7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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