Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Malsu1Q9CWV0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms