Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
NubplQ9CWD8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms