Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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