Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms