Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb9Q9CQJ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ndufb9Q9CQJ8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms