Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nudt21Q9CQF3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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