Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RTRAFQ9CQE8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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