Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms