Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc5Q9CQA1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms