Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Pkp2Q9CQ73 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pkp2Q9CQ73 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pkp2Q9CQ73 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pkp2Q9CQ73 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pkp2Q9CQ73 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pkp2Q9CQ73 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pkp2Q9CQ73 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pkp2Q9CQ73 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pkp2Q9CQ73 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pkp2Q9CQ73 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pkp2Q9CQ73 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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