Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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NenfQ9CQ45 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NenfQ9CQ45 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NenfQ9CQ45 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NenfQ9CQ45 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NenfQ9CQ45 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms