Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NsmfQ99NF2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms