Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrrtQ99MR6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms