Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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PtprtQ99M80 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PtprtQ99M80 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PtprtQ99M80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprtQ99M80 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprtQ99M80 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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