Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gdpd3Q99LY2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms