Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NgrnQ99KS2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms