Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp11Q99K46 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms