Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Higd1bQ99JY6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms