Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krcc1Q99JT5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms