Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Smim11aQ99J19 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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