Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf144aQ925F3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf144aQ925F3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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