Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep57l1Q8VDS7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cep57l1Q8VDS7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms