Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc8Q8VD72 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms