Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zcchc18Q8VD24 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Zcchc18Q8VD24 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc18Q8VD24 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms