Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf183Q8QZS5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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