Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hecw1Q8K4P8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms