Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpv3Q8K424 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpv3Q8K424 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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