Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Casc3Q8K3W3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms