Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vrk3Q8K3G5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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