Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssh3Q8K330 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Ssh3Q8K330 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ssh3Q8K330 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ssh3Q8K330 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ssh3Q8K330 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ssh3Q8K330 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ssh3Q8K330 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Ssh3Q8K330 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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