Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcf3Q8K268 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Abcf3Q8K268 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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