Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek9Q8K1R7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms